Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC6A13Q9NSD5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms