Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FZD3Q9NPG1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms