Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF17Q9BXT8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF17Q9BXT8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms