Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYCP2Q9BX26 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2Q9BX26 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms