Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGIP1Q9BQI5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms