Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCT8L2Q96SF2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms