Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC7Q96M83 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC7Q96M83 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms