Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPNQ96H22 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms