Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms