Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms