Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHIPQ8WWQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHIPQ8WWQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHIPQ8WWQ0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHIPQ8WWQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms