Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLEC4CQ8WTT0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLEC4CQ8WTT0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms