Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NanogQ80Z64 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms