Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms