Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF18Q5VWM3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms