Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPRD2Q5VT52 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms