Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMSAP1Q5T5Y3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMSAP1Q5T5Y3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms