Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LTC4SQ16873 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTC4SQ16873 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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