Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NEDD8Q15843 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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