Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCOA1Q15788 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCOA1Q15788 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms