Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXE3Q13461 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms