Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3B2Q13435 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3B2Q13435 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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