Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL9Q07325 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL9Q07325 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms