Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CLTCQ00610 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTCQ00610 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms