Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRB1P82279 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRB1P82279 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRB1P82279 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CRB1P82279 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB1P82279 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB1P82279 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB1P82279 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRB1P82279 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRB1P82279 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms