Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK-24P63145 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK-24P63145 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms