Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms