Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA4P43694 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA4P43694 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA4P43694 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA4P43694 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA4P43694 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA4P43694 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA4P43694 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GATA4P43694 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATA4P43694 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATA4P43694 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATA4P43694 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GATA4P43694 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GATA4P43694 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GATA4P43694 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms