Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5CP41229 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5CP41229 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms