Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCKARP32238 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCKARP32238 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCKARP32238 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCKARP32238 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCKARP32238 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCKARP32238 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCKARP32238 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms