Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 MTND4P30-201ENST00000450281 899 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC025572.1-201ENST00000472243 553 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 NFRKB-205ENST00000526940 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD11P31277 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC130448.1-201ENST00000624179 1733 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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