Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDM5AP29375 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KDM5AP29375 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KDM5AP29375 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KDM5AP29375 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDM5AP29375 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KDM5AP29375 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDM5AP29375 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KDM5AP29375 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms