Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLD1P28340 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLD1P28340 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLD1P28340 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLD1P28340 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms