Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC3P19447 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms