Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSPP15924 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSPP15924 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSPP15924 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSPP15924 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSPP15924 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms