Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRFP10586 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms