Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GLI3P10071 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GLI3P10071 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GLI3P10071 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GLI3P10071 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GLI3P10071 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GLI3P10071 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI3P10071 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI3P10071 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI3P10071 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI3P10071 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI3P10071 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI3P10071 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI3P10071 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI3P10071 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms