Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MMP3P08254 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MMP3P08254 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MMP3P08254 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MMP3P08254 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms