Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSF1RP07333 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF1RP07333 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms