Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP4O75379 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms