Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUX1O43812 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUX1O43812 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUX1O43812 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms