Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXA3O43365 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms