Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLRMTO00411 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms