Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B4E171 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
B4E171 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
B4E171 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
B4E171 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
B4E171 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
B4E171 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
B4E171 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms