Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSDA5PKW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSDA5PKW4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms