Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms