Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SFI3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms