Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SMG9Q9H0W8 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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