Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RTN1Q16799 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms