Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNTB1Q13884 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms